Новый алгоритм помог найти тысячи повторяющихся элементов в геномах бактерий

Новый алгоритм помог найти тысячи повторяющихся элементов в геномах бактерий

Ученые из ФИЦ Биотехнологии РАН разработали математический алгоритм, позволяющий с высокой точностью находить повторяющиеся элементы в геномах. Авторы протестировали подход на генетических последовательностях девяти видов бактерий, и у всех обнаружили ранее неизвестные повторы. Так, например, оказалось, что почти 50% генома кишечной палочки представлено довольно длинными повторами (размером 400–600 пар нуклеотидов). Эти повторы представляют собой определенный код, который наложен на существующие гены бактерий поверх кодирования аминокислот. Найденные […]

Генетики ЮФУ определили внешность хазар, живших на Дону в VII–IX веках

Генетики ЮФУ определили внешность хазар, живших на Дону в VII–IX веках

Ученые ЮФУ совместно с Институтом молекулярной биологии РАН провели ДНК-фенотипирование останков из элитных погребений Юга России хазарского времени. Выяснилось, что большинство исследованных хазар относятся к смешанному монголоидно-европеоидному типу. В VII–VIII веках на Северо-Восточном Кавказе и в пространстве между Волгой и Доном из кочевых и оседлых народов сложилось мощное средневековое государство Хазарский каганат с яркой самобытной культурой. Однако отсутствие достаточного количества письменных источников ставит перед учеными множество вопросов. Один из них – […]

МикроРНК в везикулах стволовых клеток помогли разрешить фиброз легких

МикроРНК в везикулах стволовых клеток помогли разрешить фиброз легких

Тяжелая и хроническая пневмония развивается в результате легочных инфекций, среди которых COVID-19, а также аутоиммунных заболеваний, ожогов, воздействия токсикантов и пр. При этом воспаляется ткань, через которую происходит газообмен, и затем возможно ее замещение на нефункциональную соединительную – возникают так называемые фибротические очаги. Последние составляют преимущественно миофибробласты, в чрезмерных количествах синтезирующие коллаген и способные к сокращению за счет волокон гладкомышечного актина. К краям таких очагов подтягиваются новые фибробласты, расширяя площадь […]

Мутация в гене миторегулина ускорила появление возрастных патологий почек

Мутация в гене миторегулина ускорила появление возрастных патологий почек

Митохондрия – одна из важнейших органелл клеток для многоклеточных организмов. Главная ее задача – снабжать организм энергией, получаемой при окислении разных соединений, например жирных кислот. Кроме того, эти органеллы участвуют в хранении и передаче наследственной информации: они имеют собственную ДНК, которая наследуется по материнской линии, и в случае сбоев могут возникнуть генетические заболевания, начинающиеся еще на стадии зародыша. Митохондриальные заболевания впервые обнаружили в 1988 году, […]

Как ломаются батарейки нашего тела? Отвечают генетики

Как ломаются батарейки нашего тела? Отвечают генетики

С возрастом митохондрии – энергетические станции клеток – могут утрачивать фрагменты своей ДНК. Это чревато различными патологиями, особенно мозга и мышц. Понимание механизмов утраты фрагментов митохондриальной ДНК позволит разработать методику остановки деградации важных тканей. Так, международный коллектив, в который вошли сотрудники БФУ имени Иммануила Канта, выяснил, что некоторые участки митохондриального генома находятся в зоне повышенного риска из-за особенностей, которыми они обладают. Результаты работы помогут в предсказании […]

Сибирские ученые создают технологии доставки генов, нейтрализующих ковид

Сибирские ученые создают технологии доставки генов, нейтрализующих ковид

Две технологии доставки геномных кассет – фрагментов ДНК, нейтрализующих антитела коронавируса, разрабатываются сотрудниками Сибирского отделения Российской академии наук (СО РАН) по нацпроекту «Наука и университеты». Об этом сообщает Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН. «Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН работает над Технологической платформой для экстренного создания средств профилактики и терапии вирусных инфекций на примере SARS-CoV-2-нейтрализующих антител. Эта работа происходит в рамках выполнения федеральной научно-технической программы и необходима для поддержания технологической […]

В поисках утраченных автохтонов

В поисках утраченных автохтонов

В мае этого года сотрудники Курчатовского геномного центра Зоригто Намсараев, Алексей Корженков и Дмитрий Федосов провели первую экспедицию в Республику Дагестан. В России было описано около полутора сотен автохтонных сортов винограда. Многие из них за последние десятилетия, к сожалению, были утеряны. Экспедиция, возглавленная Курчатовским геномным центром, преследует поистине важную цель – найти, определить, описать и восстановить утраченные некогда виноградные сорта. В ходе экспедиции было отобрано более 30 […]

Новый набор плазмид упростит генетическую модификацию метилотрофных дрожжей

Новый набор плазмид упростит генетическую модификацию метилотрофных дрожжей

Система CRISPR–Cas9 адаптирована для геномного редактирования множества разных организмов, однако существующие подходы к генетической модификации довольно трудоемки и часто низкоэффективны. В частности, такая проблема существовала и в случае метилотрофных дрожжей, широко используемых для производства ценных в фармакологии и пищевой промышленности белков. Сотрудники ФИЦ Биотехнологии РАН с коллегами разработали набор плазмид, доставляющих в клетки гены компонентов CRISPR–Cas9 в виде отдельных молекул ДНК, которые объединяются в одну генетическую конструкцию прямо в дрожжах. Это позволило значительно упростить […]

Создание уникального центра генной терапии стартует в «Сириусе» до конца 2023 года

Создание уникального центра генной терапии стартует в «Сириусе» до конца 2023 года

На федеральной территории «Сириус» появится опытно-промышленный производственный участок, который будет изготавливать препараты генной терапии для индивидуальных пациентов. Его проектирование начинается в 2023 году. Об этом во время Петербургского международного экономического форума рассказала председатель Совета федеральной территории Елена Шмелева. Разработка препаратов проводится на базе Научно-технологического университета «Сириус», где работает направление «Генная терапия». Напомним, что в конце 2022 года на встрече с президентом РФ Владимиром Путиным молодые […]

Ученые «нокаутируют» гены, чтобы повысить устойчивость растений к стрессу

Ученые «нокаутируют» гены, чтобы повысить устойчивость растений к стрессу

В ТГУ впервые в России будут редактировать геномы растений с помощью технологии CRISPR/Cas9, чтобы повысить их устойчивость к засухе, засолению, высоким и низким температурам. – Глобальные изменения климата сопровождаются нарушением экологического водного баланса окружающей среды, увеличением засоленных территорий и ростом нестабильности температуры, – говорит сотрудник лаборатории инженерной биологии растений Биологического института ТГУ Марина Ефимова. – Нехватка воды стала общечеловеческой проблемой, а засуха и засоление превратились в ключевой фактор, препятствующий развитию сельского […]