Победителями дополнительного конкурсного отбора на предоставление грантов на реализацию отдельных мероприятий Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019–2027 годы (III очередь. Исследовательские программы, подпункт «в») стали Казанский научный центр РАН, Томский государственный университет и Московский государственный университет имени Ломоносова. Каждый из них получит по 320 млн рублей. Конкурс проходил по тематике «Поиск и изучение микроорганизмов и микробных сообществ почв, […]
Биоинформатики разработали метод анализа параллельных изменений бактериальных геномов
Разработанный учеными ИТМО совместно с Институтом науки и технологии Австрии алгоритм PaReBrick позволяет автоматически идентифицировать параллельные перестройки в бактериальных популяциях. Сначала инструмент изучает коллекцию штаммов, представленных в виде последовательности общих блоков в геномах различных живых организмов, и их филогенетическое дерево, которое демонстрирует эволюционные взаимосвязи между ними. Затем он определяет перестройки в геноме и визуализирует информацию на филогенетическом дереве, отображающем нужный признак, […]
Генетические методы показали, что в Поволжье вселился вид дальневосточных водяных блох
Сотрудники Института проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН и Института биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН генетическими методами изучили популяции водяных блох (Daphnia curvirostris — «дафния курносая») в Европейской части России. В одном пруду на Самарской Луке (большой излучине Волги между городами Тольятти и Самара) была обнаружена интересная популяция. Исследованные самки по митохондриальному гену COI распались на […]
От результатов генетических исследований северного оленя зависит благополучие коренных народов региона
Сотрудники научной лаборатории северного оленеводства Ямальской опытной станции (г. Салехард), принадлежащей Тюменскому научному центру СО РАН, приступают к изучению генофонда ненецкой породы северного оленя. В октябре 2021 года лаборатория получила финансирование от Минобрнауки на проведение многолетних исследований по теме: «Изучение, сохранение и рациональное использование генетических ресурсов северных оленей в целях создания фундаментальных основ направленного селекционного процесса». «За последние 20-30 лет […]
Новая методика анализа метагеномов не требует обращения к референсным базам
Ученые из НИИ Физико-химической медицины ФМБА РФ, МФТИ и Университета ИТМО разработали новый метод сравнения метагеномов. В основе метода лежит представление о геномных последовательностях как о наборе всех встречающихся нуклеотидных «слов», k-меров, где k — длина сочетания нуклеотидов A, T, G, C. Метагеном — это совокупность генетического материала всех бактерий, населяющих какую-либо нишу организма. Когда в секвенатор закладывается материал из некоторой среды (например, кишечника), то в нем […]