ИЦиГ выступил организатором крупнейшей в российской истории конференции, посвященной Big Data в науках о жизни
Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирский государственный университет и Научный совет по биоинформатике СО РАН выступили организаторами 14-й Международной конференции «Биоинформатике регуляции и структуры геномов / системная биология» (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure / Systems Biology, BGRS\SB-2024), которая проходила с 5 по 10 августа 2024 года.
БГРС – это самая длинная в мире по своей непрерывной истории крупная международная конференция в области биоинформатики и системной компьютерной биологии (26 лет, начиная с 1998 года), в которой приняли участие тысячи ученых из десятков стран мира. Программа мультиконференции была разделена на тринадцать симпозиумов, в рамках которых было заслушано 793 доклада.
А всего в работе мультиконференции приняло участие более 1000 человек (в т.ч. очно – 680) из 32 стран. Для сравнения, в прошлой BGRS\SB-2022 участвовало около 900 ученых из 34 стран. Эта динамика говорит о том, что проблемы биоинформатики и роли «больших генетических данных» в развитии наук о жизни пользуются огромным интересом в научном сообществе.
Открывая конференцию, председатель Президиума BGRS/SB-2024, научный руководитель ИЦиГ СО РАН, академик РАН Николай Колчанов отметил:
– Стремительное развитие омиксных технологий (геномики, транскриптомики, протеомики, метаболомики) и других высокопроизводительных методов экспериментального исследования молекулярно-генетических систем и процессов привело к информационному взрыву в генетике, и она стала главным источником больших данных, перегнав по темпам роста и объемам накапливаемой информации не только все другие науки и технологии, но и мировые социальные сети. В связи с этим сегодня перед биоинформатикой и системной компьютерной биологией стоят очень серьезные задачи. Прежде всего, это анализ больших генетических данных и на этой основе – реконструкция, анализ и моделирование структурной организации и молекулярно-генетических механизмов функционирования геномов и кодируемых ими генетических макромолекул (ДНК, РНК и белков), а также генных сетей – ансамблей координированно функционирующих генов), обеспечивающих формирование всех без исключения фенотипических признаков и характеристик клеток, тканей, органов, целостных организмов, а также воспроизведение популяций и даже функционирование экосистем.
Характерной особенностью конференции является то, что она вызывает интерес не только у биологов, генетиков и медиков, но также и у математиков и специалистов, работающих в области информационных технологий
– Если мы говорим о задачах, которые стоят перед математиками в плане работы с биологами, то это, безусловно, обработка и анализ больших генетических данных и на этой основе – реконструкция, компьютерный анализ и моделирование молекулярно-генетических систем и процессов на различных иерархических уровнях организации живых систем. Эти подходы в ряде случаев способны заменить дорогостоящие и очень сложные по своей реализации эксперименты и позволяют вполне адекватно предсказывать поведение живых систем в ответ на воздействие различных внутренних и внешних факторов. История нашей науки показывает, что это очень сложная, но, тем не менее, решаемая задача», – подчеркнул директор Института вычислительной математики и математической геофизики, профессор РАН Михаил Марченко.
Подводя научные итоги конференции, академик Колчанов отметил, что науки о жизни входят в новую эру больших генетических данных, и этот переход требует трансформации базовых подходов биоинформатики и системной компьютерной биологии:
– В чем это проявляется? Во-первых, в широчайшем применении методов искусственного интеллекта и их интеграции с классическими методами биоинформатики и системной компьютерной биологии. Во-вторых, в разработке на этой основе нового поколения информационно-программных систем для планирования экспериментов по проверке результатов компьютерных предсказаний, полученных на основе анализа больших генетических данных. Движение в этом направлении будет означать, фактически, смену базовой парадигмы исследований: от науки, направляемой гипотезами, к науке, направляемой большими данными. И биоинформатика, как показывает проведенная нами конференция, находится на острие этого движения к новой биологии.
Фото: пресс-служба Института цитологии и генетики СО РАН