На интенсиве по биоинформатике в ТГУ все желающие учились «читать» геномы
В Томском государственном университете прошел трехдневный интенсив для желающих погрузиться в мир геномики и биоинформатики. Ученики и учителя школ, студенты и преподаватели вузов Большого университета Томска и из других регионов за три дня научились собирать геномные последовательности бактериофагов, выявлять возникшие в геномах бактериофагов мутации, анализировать аминокислотный состав антирестрикционных белков, предсказывать их третичную структуру при помощи пайплайна AlphaFold2.
Интенсив «Поиск новых ингибиторов рестрикции у бактериофагов» от лаборатории анализа метагеномов Сколковского института науки и технологий и Института образования ТГУ привлек более 130 участников. Открыла курс лекция известного ученого и популяризатора науки Константина Северинова. Специалист в области молекулярной биологии, доктор биологических наук, профессор Сколковского института науки и технологий рассказал о развитии технологий геномного редактирования.
Как отметил один из организаторов интенсива, научный сотрудник лаборатории анализа метагеномов Сколковского института науки и технологий Матвей Колесник, в последнее время в связи с разработкой, удешевлением и усовершенствованием методов секвенирования ДНК происходит очень активное накопление геномных данных – последовательностей геномов отдельных организмов и метагеномов. Эта информация накапливается гораздо быстрее, чем ее успевают исследовать, и ученые охотно сотрудничают со школьниками, которые собираются связать свою учебу и работу с биологией. Те, в свою очередь, получают опыт, который пригодится им впоследствии.
Программа интенсива включала лекцию о защитных системах прокариот и практические занятия по обработке данных высокопроизводительного секвенирования.
– Участниками стали старшеклассники и учителя, студенты и сотрудники томских вузов: ТГУ, ТПУ, СибГМУ, сотрудники разных субъектов ТНИМЦ, даже профессора. Также мы получали заявки от участников из МГУ, ВШЭ, МИИГАиК и очно к нам приехали учащиеся НГУ. Мы старались сделать интенсив максимально доступным. Институт образования оборудовал специальную аудиторию и предоставил участникам порядка 100 рабочих мест с современными производительными ноутбуками и стабильным интернет-подключением, – рассказал специалист Центра развития современных компетенций детей и молодежи Института образования ТГУ Дмитрий Ким.
Аналогичные интенсивы уже проводились в Санкт-Петербурге и Нижнем Новгороде. По их результатам ученые лаборатории анализа метагеномов Сколковского института науки и технологий начали совместную работу с заинтересованными студентами.
В ТГУ продолжением сотрудничества с лабораторией анализа метагеномов станет образовательная программа «Метагеномика микробных сообществ». Ее запустят осенью 2023 года. Программа включает лекционный курс, посвященный молекулярной биологии прокариот и биоинформатическому анализу метагеномных данных, а также работу над индивидуальными биоинформатическими проектами.
Фото: известный ученый и популяризатор науки Константин Северинов в ТГУ. Источник: пресс-служба ТГУ