Новые белки-партнеры эритропоэтина обнаружили ученые из Института биологического приборостроения РАН
Лаборатория новых методов в биологии ИБП РАН имеет многолетний опыт изучения кальций-связывающих белков с помощью современных физико-химических методов. В работе, опубликованной в журнале «Biomolecules», (Kazakov, A.S.; Deryusheva, E.I.; Sokolov, A.S.; Permyakova, M.E.; Litus, E.A.; Rastrygina, V.A.; Uversky, V.N.; Permyakov, E.A.; Permyakov, S.E. Erythropoietin Interacts with Specific S100 Proteins. Biomolecules 2022, 12, 120, https://doi.org/10.3390/biom12010120), методом поверхностного плазмонного резонанса оценивали параметры взаимодействия эритропоэтина с потенциальными «контрагентами». Из 18 кандидатов были выбраны три белка, способные специфически связываться с эритропоэтином. Детали межмолекулярных контактов были изучены методами молекулярного моделирования, основываясь на данных трехмерных структур белков-партнеров. Проведенный анализ подтвердил наличие схожих паттернов пространственной ориентации взаимодействующих молекул. Биоинформатический анализ ассоциаций обнаруженных взаимодействий эритропоэтин-S100 с заболеваниями указывает на их вовлеченность в развитие онкологических и прочих заболеваний. Работа демонстрирует филигранное владение методами исследования надмолекулярных комплексов и имеет большое фундаментальное значение для реконструкции целостного интерактома эритропоэтина.
Примечательно, что значение этой работы выходит за рамки фундаментальной науки и заставляет по-новому взглянуть на применение эритропоэтина в медицине, открывая возможности для разработки методов персонифицированной медицины. Работа выполнена при поддержке Российского научного фонда (грант №19-14-00289).
Фото: пресс-служба Пущинского научного центра биологических исследований