Оборудование для маркер-ориентированной селекции запустили в ИЦиГ СО РАН
Современные технологии селекции невозможны без использования соответствующей (и достаточно дорогостоящей) приборной базы. Такой, как сканер биочипов высокой плотности iScan System, установленный в Секторе геномных исследований Института цитологии и генетики СО РАН.
Этот прибор позволяет осуществлять быстрый скрининг на какие-то уже известные мутации. Одно из очевидных применений – в области маркер-ориентированной селекции растений и животных. Селекционеру на этапе выбора перспективных линий для создания нового сорта нужно быстро и точно выбрать растения, которые унаследовали необходимый ценный признак и проводить дальнейшую селекционную работу именно с ними. Как правило, речь идет об оценке сотен растений, полногеномное секвенирование в таких масштабах стоит очень дорого. В прошлом селекционерам приходилось выбирать перспективных кандидатов буквально «на глаз», что значительно снижало точность результатов и серьезно увеличивало срок работы над сортом.
«Наш биосенсор позволяет решить эту задачу быстро, относительно недорого и самое главное – достаточно точно. Поскольку маркер-ориентированная селекция подразумевает, что ученым уже известно какие мутации отвечают за необходимый признак, а прибор четко показывает, есть они в данном растении или нет», — рассказал руководитель сектора геномных исследований ИЦиГ СО РАН к.б.н. Геннадий Васильев.
Другое направление, в котором востребованы подобные приборы – популяционные медицинские исследования, направленные на поиск генетических факторов риска тех или иных заболеваний. Число подобных научных работ с каждым годом только возрастает и теперь ученые Академгородка получили возможность проводить подобный скрининг в Новосибирске, а не заказывать его в сторонних научных центрах (обычно – зарубежных).
На биосканере уже успели выполнить несколько работ по заказу ученых «Курчатовского геномного центра ИЦиГ СО РАН», в будущем, прогнозируют сотрудники сектора круг пользователей нового прибора значительно расширится, в том числе, за счет сотрудников других институтов Новосибирского научного центра.
Фото: Пресс-служба ИЦиГ СО РАН