Российские ученые исследуют «генетическую темную материю» в бактериях, важных для сельского хозяйства
Сотрудники лаборатории генетики и селекции микроорганизмов Всероссийского научно-исследовательского института сельскохозяйственной метеорологии (ВНИИСХМ) под руководством М.Л. Румянцевой провели масштабное исследование phiLM21-подобных профагов у клубеньковых бактерий. Результаты работы опубликованы в высокорейтинговом журнале International Journal of Molecular Sciences.
Изучение профагов, сайт-специфически интегрированных в гены тРНК, показало, что до 65 % их метавирома кодирует гипотетические белки ‒ «генетическую темную материю». Анализ открытых рамок считывания (ОРС) разного происхождения, а также распределение ОРС с предсказанными и с неизвестными функциями, наглядно представлен в статье.
«Исследование демонстрирует, что в бактериальных геномах скрыт обширный массив фаговых последовательностей, кодирующих белки с невыясненными функциями ‒ так называемая «генетическая темная материя», ‒ пояснила заместитель директора ВНИИСХМ, кандидат биологических наук Вера Сафронова. ‒ Расшифровка этого скрытого потенциала является ключевой задачей, решение которой позволит получить новые знания о коэволюции бактерий и фагов и откроет новые перспективы для синтетической биологии и биоинженерии».
Исследование выполнено при поддержке Минобрнауки России в рамках соглашения № 075-15-2025-472 от 29 мая 2025 года о предоставлении гранта на реализацию проекта «Расширение фонда и развитие геномных исследований в коллекции микроорганизмов Сетевая биоресурсная коллекция в области генетических технологий для сельского хозяйства (ВКСМ)».
Рисунок: пресс-служба ВНИИСХМ