Российские ученые создают уникальный цифровой генетический ресурс для разработок в области птицеводства
Ученые Научного Центра «Регуляторная Геномика» (КФУ) и Университета Сириус создают базу данных Chicken_GTx_Russia для приоритизации целей для селекции на основе геномных и транскриптомных данных с целью усиления полезных признаков кур. Об этом сообщили в пресс-службе Казанского федерального университета.
В 2021–2022 гг. на основе транскриптомного и геномного анализа второго поколения (F2) создаваемой ресурсной популяции гибридов мясных и яйценосных пород кур был создан прототип базы данных, которая включает более 200 образцов, отражающих профили работы генов и особенности генома кур.
В 2023 году разработка была дополнена данными по результатам секвенирования геномов всех птиц, использованных в исследовании. Собраны референсные геномы родительской формы (оригинальная российская порода русская белая) и кроссов F2, использованных в анализе.
Благодаря геномным данным был усовершенствован алгоритм анализа аллель-специфичной экспрессии, связанный с фенотипическими признаками кур; проведен широкомасштабный анализ изменения метаболомного профиля (абсолютные концентрации более 100 метаболитов) в исследуемых тканях кур; создан цифровой контур базы данных на российской платформе GTRD.
Создание цифровой генетической платформы, ориентированной на выделение взаимосвязи геномных особенностей с полезными признаками пород и их гибридов в РФ, станет одним из залогов успешного развития программ выведения новых линий кур. Это позволит снизить общие трудозатраты на проекты такого рода за счет in silico предсказания лучших целей и генетических маркеров и их влияния на полезные признаки птиц. До настоящего времени подобного ресурса в РФ не существовало, хотя США, ЕС и другие страны активно разрабатывают такие инструменты и пользуются ими.
Планируется также выделить в геноме кур набор биомаркеров для диагностической панели, которая позволит фермерским хозяйствам малого и среднего размера отбирать птиц с полезными признаками для дальнейшего разведения.
Источник: Министерство экономики Республики Татарстан
Фото: wirestock / Freepik