ТАСС: создан первый в России прибор, синтезирующий тысячи фрагментов ДНК
Ученые пяти институтов Сибирского отделения Российской академии наук (СО РАН) разработали макет микрочипового синтезатора, который способен синтезировать в одном эксперименте 12 тыс. коротких фрагментов ДНК и РНК – олигонуклеотидов. Они необходимы для диагностики, синтетической биологии и персонализированной медицины. Традиционный синтезатор позволяет получать 8 или 96 олигонуклеотидов, рассказал ТАСС ведущий научный сотрудник Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Александр Синяков.
Олигонуклеотиды – короткие синтетические фрагменты ДНК и РНК, на основе которых можно создавать диагностические системы, терапевтические ген-направленные препараты и конструировать искусственные биологические системы с заданными свойствами. Работа выполнена сотрудниками ИХБФМ СО РАН, Новосибирским институтом органической химии им. Н.Н. Ворожцова, Международным томографическим центром, Институтом физики полупроводников им. А.В. Ржанова и Институтом автоматики и электрометрии СО РАН.
«Нам удалось синтезировать 12 тыс. олигонуклеотидов», – сказал А. Синяков, добавив, что в данный момент ученые работают над возможностью получать одновременно сотни тысяч фрагментов ДНК.
Реакционная камера устройства и его система управления синтезом отличаются от традиционного синтезатора. В новой разработке используется плата из 800 тыс. управляемых микрозеркал, каждое из которых может отразить ультрафиолет на подложку, где идет синтез.
«В настоящее время нужны сотни тысяч и миллионы олигонуклеотидов для определения разного рода патогенов так называемой методикой нового секвенирования. Для того, чтобы выделить мишени известных вирусов, нужны миллионы олигонуклеотидов. Если делать на традиционных синтезаторах – это очень долго и дорого», – отметил Синяков.
Для создания искусственного генома человека, состоящего из 3 млрд пар нуклеотидов на традиционном 96-луночном синтезаторе, потребовалось бы работать в три смены в течение 1,3 тыс. лет, привел пример ученый.
Фото: kjpargeter/Freepik