Ученые ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста провели геномную оценку и изучили генетические взаимосвязи автохтонных пород овец России и Персидского нагорья
Генерация полногеномных SNP-профилей для многочисленных трансграничных и локальных пород и популяций домашних животных, которые, благодаря унифицированной технологии генотипирования, можно легко объединить и обработать как единый пул, – это один из наиболее впечатляющих результатов внедрения ДНК-чипов. Таким образом, оценка полногеномного разнообразия видов сельскохозяйственных животных сместилась с локального на глобальный уровень.
Геномная оценка автохтонных пород овец имеет важное значение для реконструкции миграций, произошедших в результате постдоместикационных событий, и для заполнения пробелов в истории формирования современных пород овец в Евразии.
Коллектив авторов из ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста (с.н.с., рук. группы к.б.н. Т.Е. Денискова, в.н.с., рук. лаборатории к.б.н. А.В. Доцев, м.н.с. О.А. Кошкина, академик Н.А. Зиновьева) в сотрудничестве с иранскими (д.н., профессор А. Эсмализаде, д.н. М. А. Фарахваши, д.н. М. Мохтари, д.н. М.М. Хабиси) и другими учеными (д.н. Ф.Х. Лв) провели молекулярно-генетическое исследование, направленное на выявление предполагаемых генетических взаимосвязей между локальными породами овец России и Персидского нагорья (Иран) на основе генотипов SNP высокой плотности. Триста девяносто пять овец, принадлежащих к 11 иранским и 10 российским породам, были генотипированы с использованием ДНК-чипа высокой плотности Ovine Infinium HD BeadChip (Illumina, Сан-Диего, Калифорния, США).
Анализ главных компонент, оценка максимального правдоподобия и анализ структуры генетической сети Neighbor-Net продемонстрировали, что российские породы овец европейского происхождения четко различаются от группы овец, состоящей из иранских локальных пород и российских пород азиатского происхождения. Кластерный анализ с использованием программы Admixture выявил наличие общих предковых компонентов в геномах некоторых иранских автохтонных пород и российских жирнохвостых грубошерстных пород овец.
Полученные результаты способствуют лучшему пониманию закономерностей формирования и распространения общих предковых элементов, присутствующих в геномах многих евразийских пород овец.
Результаты работы опубликованы в статье «A Search for Eurasian Sheep Relationships: Genomic Assessment of the Autochthonous Sheep Breeds in Russia and the Persian Plateau», которая представлена в рамках специального выпуска «Genetic Diversity, Population Structure, and Ancestral Origin of Livestock» в журнале Diversity (Scopus Q1/ WoS Q2).