В Национальную базу данных геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2 (VGARus) загружено более 150 тысяч сиквенсов
На 16 августа 2022 г. в Национальную базу данных геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2 (VGARus) загружено 150981 сиквенсов, в том числе более 78 тысяч полногеномных последовательностей и свыше 71 тысячи фрагментов генома S-белка (участок, позволяющий определять наиболее важные мутации). Такое существенное расширение отечественной «библиотеки коронавируса» стало возможным благодаря консолидации научных и медицинских учреждений нашей страны.
Обширное накопление информации имеет стратегическое значение для обеспечения эпидемического благополучия населения, поскольку позволяет отслеживать появление новых геновариантов и контролировать их распространение, эффективно оценивать эпидемиологическую ситуацию и принимать своевременные решения об организации профилактических мероприятий.
Платформа VGARus (Virus Genome Aggregator of Russia) была разработана в ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора и введена в действие в соответствии с распоряжением Правительства РФ от 23 марта 2021 г. № 448 о необходимости создания единого информационного центра для анализа эпидемической ситуации и отслеживания циркулирующих в стране геновариантов коронавируса. В процесс ее пополнения и проведения массового секвенирования включились многие научные и медицинские учреждения страны, образовав своего рода научный консорциум в сфере геномных исследований.
В настоящее время в системе VGARus зарегистрировано 146 организаций, из них 31 регулярно загружает сиквенсы. Наиболее существенный вклад в пополнение базы данных вносят учреждения Роспотребнадзора: ЦНИИ Эпидемиологии, ГНЦ ВБ «Вектор», ГНЦ Прикладной микробиологии и биотехнологии, НИИ Дезинфектологии, НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Российский НИПЧИ «Микроб», а также Минздрава РФ: НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева, ДЦЛИ ДЗМ.
Объединение усилий для сбора и изучения информации о геномах коронавируса является примером беспрецедентного современного научного сотрудничества и позволяет успешно решать важнейшие задачи эпидемиологии.Кроме того, благодаря российским научным и медицинским учреждениям продолжается активное пополнение международной базы данных GISAID. К августу она насчитывала 21828 последовательностей вируса SARS-CoV-2, полученных полностью в РФ. Наибольший вклад внес ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, загрузив 9469 сиквенсов. Все эти данные служат основой для изучения геновариантов, циркулирующих в России, учеными всего мира.
Фото: сайт ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора