В России впервые создан банк данных микробной ДНК

Ученые Всероссийской коллекции микроорганизмов и «Пущинского научного центра биологических исследований Российской академии наук» создали базу данных ВКМ ГЕН (VKMGen), о нуклеотидных последовательностях ДНК микроорганизмов. Исследования проводились в рамках Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019-2027 годы национального проекта «Наука и университеты».

«Созданная база данных связывает в единую систему всю информацию из фонда ВКМ, сохраняемую локально в ВКМ и/или доступную в международных базах данных, в частности, в GenBank Национального центра биотехнологической информации (NCBI), США», – говорится в сообщении пресс-службы ФИЦ «Пущинский научный центр биологических исследований РАН».

В настоящее время ВКМ ГЕН содержит данные о более чем 3000 нуклеотидных последовательностях различных генов и полных геномов представителей микробного мира (бактерий, актиномицетов, архей, мицелиальных и дрожжевых грибов). Информация о более 500 последовательностях получена коллективом ВКМ и хранится пока только в России, в созданной базе данных. В числе микроорганизмов, сведения о ДНК которых можно найти в ВКМ ГЕН – обитатели сухих среднеазиатских пустынь и болот Сибири, пришельцы из вечной мерзлоты Арктики и Антарктики, симбионты краснокнижных растений, потенциальные продуценты новых лекарственных средств, а также другие уникальные и биотехнологически ценные представители мира микробов. Поисковая система ВКМ ГЕН содержит семь видов запросов для извлечения интересующей пользователей информации.

В 2023 году продолжается расширение базы данных, запланированы работы по организации открытого доступа к ней научного сообщества. 

Источник: ФГБУН «ФИЦ «Пущинский научный центр биологических исследований РАН»