Опубликована статья сотрудников МГНЦ, посвященная изучению влияния трисомий на пространственную организацию хроматина в геноме человека
В журнале «International Journal of Molecular Sciences» опубликована статья с участием сотрудников МГНЦ, о влиянии трисомий на пространственную организацию хроматина в геноме человека.
Трисомии, т.е. увеличение числа отдельных хромосом, характеризуются изменениями уровня экспрессии генов, локализованных не только на дополнительной хромосоме, но и по всему геному.
При использовании метода захвата конформации хромосом и высокопроизводительного секвенирования (Hi-C) была изучена трехмерная структура хроматина в клетках хориона и культивированных фибробластов кожи, несущих либо дополнительную хромосому 13, либо хромосому 16, либо хромосому 18. Показано, что наличие дополнительных хромосом приводит к систематическим изменениям частот контактов хроматина между малыми (16-22) и большими (1-15, X) хромосомами.
При анализе поведения отдельных хромосом в интерфазном ядре было обнаружено, что ограниченное число хромосом изменяют спектр своих контактов с другими хромосомами в клетках с трисомией. Показано, что наличие трисомии изменяет компактизацию хроматина всего генома.
Установлено, что участки генома, которые становятся более компактными в клетках с трисомией, обогащены генами домашнего хозяйства, что указывает на возможное уменьшение доступности хроматина для транскрипционных факторов и снижение уровня транскрипции этих генов.
Полученные результаты обеспечивают основу для дальнейшего понимания механизмов нарушения регуляции транскрипции в пределах всего генома при наличии трисомии в контексте пространственной организации хроматина, а также молекулярных основ патогенеза хромосомных болезней, обусловленных трисомиями.
Рисунок. Chr18 и Chr21 меняют радиальное положение в фибробластах Tr18. (A) Репрезентативные примеры нормальных ядер фибробластов и ядер Tr18. Масштабная планка — 10 мкм.